LICENSE.txt
MANIFEST.in
setup.py
lhc/__init__.py
lhc/math.py
lhc/binf/__init__.py
lhc/binf/genetic_code.py
lhc/binf/identifier.py
lhc/binf/iupac.py
lhc/binf/kmer.py
lhc/binf/skew.py
lhc/binf/alignment/__init__.py
lhc/binf/alignment/local_aligner.py
lhc/binf/alignment/local_alignment.py
lhc/binf/alignment/scoring_matrix.py
lhc/binf/genomic_coordinate/__init__.py
lhc/binf/genomic_coordinate/genomic_interval.py
lhc/binf/genomic_coordinate/genomic_position.py
lhc/binf/genomic_coordinate/nested_genomic_interval.py
lhc/binf/genomic_coordinate/nested_genomic_interval_factory.py
lhc/binf/sequence/__init__.py
lhc/binf/sequence/dicodonshuffle.py
lhc/binf/sequence/reverse_complement.py
lhc/binf/sequence/sequence_generator.py
lhc/binf/sequence/digen/__init__.py
lhc/binf/sequence/digen/digen.py
lhc/binf/sequence/digen/setup.py
lhc/collections/__init__.py
lhc/collections/inorder_access_interval_set.py
lhc/collections/inorder_access_set.py
lhc/collections/interval_map.py
lhc/collections/interval_set.py
lhc/collections/multi_dimension_map.py
lhc/collections/tracked_map.py
lhc/collections/tracked_set.py
lhc/filetools/__init__.py
lhc/filetools/filepool.py
lhc/filetools/shared_connection.py
lhc/filetools/shared_file.py
lhc/filetools/shared_filepool.py
lhc/graph/__init__.py
lhc/graph/graph.py
lhc/graph/hyper_graph.py
lhc/graph/n_partite_graph.py
lhc/indices/__init__.py
lhc/indices/tbi.py
lhc/indices/tracked_index.py
lhc/interval/__init__.py
lhc/interval/binner.py
lhc/interval/interval.py
lhc/io/__init__.py
lhc/io/cut.py
lhc/io/bam/__init__.py
lhc/io/bam/iterator.py
lhc/io/bed/__init__.py
lhc/io/bed/__main__.py
lhc/io/bed/index.py
lhc/io/bed/iterator.py
lhc/io/bed/set_.py
lhc/io/bed/tools/__init__.py
lhc/io/bed/tools/depth.py
lhc/io/bed/tools/sort.py
lhc/io/bgzf/__init__.py
lhc/io/bgzf/__main__.py
lhc/io/bgzf/tools/__init__.py
lhc/io/bgzf/tools/inspect.py
lhc/io/fasta/__init__.py
lhc/io/fasta/__main__.py
lhc/io/fasta/index.py
lhc/io/fasta/inorder_access_set.py
lhc/io/fasta/iterator.py
lhc/io/fasta/set_.py
lhc/io/fasta/wrapper.py
lhc/io/fasta/tools/__init__.py
lhc/io/fasta/tools/index.py
lhc/io/fasta/tools/wrap.py
lhc/io/fastq/__init__.py
lhc/io/fastq/__main__.py
lhc/io/fastq/iterator.py
lhc/io/fastq/split.py
lhc/io/gbk/__init__.py
lhc/io/gbk/__main__.py
lhc/io/gbk/iterator.py
lhc/io/gbk/sequence_set.py
lhc/io/gbk/tokeniser.py
lhc/io/gbk/tools/__init__.py
lhc/io/gbk/tools/extract.py
lhc/io/gbk/tools/split.py
lhc/io/gff/__init__.py
lhc/io/gff/__main__.py
lhc/io/gff/index.py
lhc/io/gff/iterator.py
lhc/io/gff/set_.py
lhc/io/gtf/__init__.py
lhc/io/gtf/__main__.py
lhc/io/gtf/index.py
lhc/io/gtf/iterator.py
lhc/io/gtf/set_.py
lhc/io/maf/__init__.py
lhc/io/maf/__main__.py
lhc/io/maf/index.py
lhc/io/maf/iterator.py
lhc/io/sam/__init__.py
lhc/io/sam/__main__.py
lhc/io/sam/clip.py
lhc/io/sam/filter.py
lhc/io/sam/iterator.py
lhc/io/txt/__init__.py
lhc/io/txt/__main__.py
lhc/io/txt/filter.py
lhc/io/txt/format_parser.py
lhc/io/txt/formatters.py
lhc/io/txt/indexed_set.py
lhc/io/txt/iterator.py
lhc/io/txt/set_.py
lhc/io/txt/tools/__init__.py
lhc/io/txt/tools/check_format.py
lhc/io/txt/tools/compress.py
lhc/io/txt/tools/decompress.py
lhc/io/txt/tools/fetch.py
lhc/io/txt/tools/index.py
lhc/io/txt/tools/join.py
lhc/io/txt/tools/sort.py
lhc/io/vcf/__init__.py
lhc/io/vcf/__main__.py
lhc/io/vcf/index.py
lhc/io/vcf/iterator.py
lhc/io/vcf/merger.py
lhc/io/vcf/set_.py
lhc/io/vcf/tools/__init__.py
lhc/io/vcf/tools/compare.py
lhc/io/vcf/tools/difference.py
lhc/io/vcf/tools/filter.py
lhc/io/vcf/tools/index.py
lhc/io/vcf/tools/merge.py
lhc/io/vcf/tools/sample.py
lhc/io/vcf/tools/split_alt.py
lhc/io/vcf/tools/trim_alt.py
lhc/itertools/__init__.py
lhc/itertools/chunked_iterator.py
lhc/itertools/sorted_iterator_merger.py
lhc/misc/__init__.py
lhc/misc/performance_measures.py
lhc/misc/string.py
lhc/misc/tools.py
lhc/random/__init__.py
lhc/random/reservoir.py
lhc/tools/__init__.py
lhc/tools/sorter.py
lhc/tools/tokeniser.py
lhc_python.egg-info/PKG-INFO
lhc_python.egg-info/SOURCES.txt
lhc_python.egg-info/dependency_links.txt
lhc_python.egg-info/requires.txt
lhc_python.egg-info/top_level.txt