.. include:: ../../global.inc
.. _manual:

####################################################################
**Ruffus** Manual: Table of Contents:
####################################################################

    :ref:`manual_introduction <manual.introduction>`

    #) :ref:`follows <manual.follows>`
    #) :ref:`tasks_as_recipes <manual.tasks_as_recipes>`
    #) :ref:`files <manual.files>`
    #) :ref:`tasks_and_globs_in_inputs <manual.tasks_and_globs_in_inputs>`
    #) :ref:`tracing_pipeline_parameters <manual.tracing_pipeline_parameters>`
    #) :ref:`parallel_processing <manual.multiprocessing>`
    #) :ref:`split <manual.split>`
    #) :ref:`transform <manual.transform>`
    #) :ref:`merge <manual.merge>`
    #) :ref:`posttask <manual.posttask>`
    #) :ref:`jobs_limit <manual.jobs_limit>`
    #) :ref:`dependencies <manual.dependencies>`
    #) :ref:`onthefly <manual.on_the_fly>`
    #) :ref:`collate <manual.collate>`
    #) :ref:`advanced_transform <manual.advanced_transform>`
    #) :ref:`parallel <manual.parallel>`
    #) :ref:`check_if_uptodate <manual.check_if_uptodate>`
    #) :ref:`exceptions <manual.exceptions>`
    #) :ref:`logging <manual.logging>`
    #) :ref:`files_re <manual.files_re>`

